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Yaxin-1165/1168荧光动力学丈量系统数据导出与整理的要领

 更新时间:2024-04-25 点击量:434

本文档适用于鸿运国际生产的Yaxin-1165植物荧光动力学丈量系统与Yaxin-1168藻类荧光动力学丈量系统的数据整理功效 。主要包括数据传输、电脑端(上位机软件)审查、导出、在EXCEL中重整理等历程 。


1.数据导出


首先毗连仪器与电脑的传输线 ,其次在仪器端点击【数据治理】 ,进入下一界面再点击【数据传输】 。接下来有两种模式可供用户选择 ,划分是【虚拟U盘模式】和【转存到SD卡】 ,两个模式选择其中一个方法即可完成数据传输 。



Yaxin-1165/1168荧光动力学丈量系统数据导出与整理的要领
1.1 数据传输


【虚拟U盘模式】:选择【虚拟U盘模式】后 ,用数据线毗连电脑 ,电脑会自转动出U盘 。翻开U盘后 ,可以显示已经生涯的文件 ,最新日期的文件为最后一次导出的数据 ,将文件复制在电脑目的文件夹下 ,后使用 PrjYG2021DV数据传输软件审查数据 。

注:在荧光仪主机的数据审查与删除功效详见说明书 ,该处不做先容 。


2  数据审查
2.1 PC端文件翻开操作
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图2.1 PrjYG2021DV软件截图


PrjYG2021DV数据传输软件为Yaxin-1165植物荧光动力学丈量系统配套的数据传输软件 ,双击翻开即可进入软件 ,软件图标如图2.1 。



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图2.2 数据传输界面


操作界面如图2.2 ,包括软件名、表格/曲线审查模式、参数列、给光模式、 丈量类型和文件名等信息 ,软件右侧第一列点击【翻开文件】 。



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图2.3 文件翻开


界面弹出“翻开文件"的界面 ,如图2.3 ,选择需要审查的文件(文件名堂“.bin") ,双击即可在软件中审查 。


2.2 单个“OJIP丈量"的表格和图片审查


以OJIP为例 ,在“丈量类型"中选择“OJIP" ,文件名框中则泛起丈量OJIP的各个文件 ,单击选择可举行审查 。在表格/曲线审查模式中可选择审查类型 ,表格模式如图2.4 ,曲线模式如图2.5 。



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图2.4 OJIP表格模式                    

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图2.5 OJIP曲线模式
2.3 多个“OJIP丈量"的表格数据和图片审查


在表格模式下的OJIP? ,按住Ctrl键可以多选文件名框中的文件举行数据审查 ,可以用来比对多项OJIP数据 ,表格模式如图2.6 。在曲线模式下的OJIP? ,按住 Ctrl键可以多选文件名框中的文件举行曲线审查 ,比对多条OJIP曲线差别 ,曲线模式如图2.7 。



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图2.6 多个OJIP表格模式                    

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图2.7 多个OJIP曲线模式
2.3 多个“脉冲瞬态荧光动力学" 的表格数据和图片审查


在表格模式下的脉冲瞬态荧光动力学? ,按住 Ctrl 键可以多选文件名框中的文件举行数据审查 ,可以用来比对多项脉冲瞬态荧光动力学数据 ,表格模式如图2.8 。在曲线模式下的脉冲瞬态荧光动力学? ,按住 Ctrl 键可以多选文件名框中的文件举行曲线审查 ,由于脉冲瞬态荧光动力学数据较多 ,需要在操作栏中选择一项数据举行比对 ,曲线模式如图2.9 。


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图2.8 多个脉冲瞬态荧光动力学表格模式                    
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图2.9 多个脉冲瞬态荧光动力学曲线模式
3  数据导出


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图3.1 OJIP丈量模式下的表格审查界面


在表格模式下如图3.1 ,选择文件后 ,点击表格上方的【生涯表格】 ,可将表格中的数据(泛起在软件表格中的数据 ,换言之盘算值)以.csv名堂生涯到PC端 ,后续用Excel即可审查或编辑 。

选中文件后 ,点击文件名框右侧的【另存为】—【生涯选中的数据(表格形式)】 ,(如图3.2)可将对应文件的原始数据以.csv名堂生涯到 PC 端 ,后续用Excel可以凭证导出的数据作图 。

注重:【生涯表格】和【另存为】这两个途径均可以导出csv名堂的数据 。【生涯表格】方法导出的是泛起在软件表格中的数据 。【另存为】导出的是原始数据 ,原始数据为随时间推移的荧光值 ,如第一列是时间 ,第二列是荧光值 。【生涯表格】包括部分丈量值和所有盘算值 。【另存为】导出的数据没有盘算值 ,是实测值 。



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图3.2 贮存方法


选择【生涯所有丈量类型数据】、【生涯目今丈量类型数据】、【生涯选中的数据】这三个选项所生涯的数据均为.bin名堂 ,该名堂不可用 Excel 表格准确读取 ,只能用我司配套的软件翻开 。


4  数据重整理
4.1导出数据怎样手工绘制OJIP曲线


找到【另存为】导出的名堂为.csv的文件 ,用EXCEL翻开该文件 ,选中Times(时间)及D1(荧光值)的所有数据如图4.1所示 。



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4.1 csv文件数据框选


点击工具栏中的插入界面 ,进入图标栏 ,插入带平滑线的散点图 ,即可获得图4.2 。


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4.2 带平滑线的散点图


随后对该图片中的横坐标举行“对数化"处置惩罚 。点击带平滑线散点图的横坐标数字 ,泛起操作界面 ,在界面中点击对数刻度 ,如图4.3 ,即可获得OJIP曲线 ,如图4.4 。



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4.3 对数化处置惩罚
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4.4 绘制OJIP曲线
4.2导出数据怎样绘制脉冲瞬态荧光动力学曲线?


脉冲瞬态荧光动力学曲线俗称“荧光曲线" ,该曲线指的是在饱和脉冲与作用光相互的作用下 ,荧光值随时间转变的曲线 。怎样绘制呢?

在表格模式下如图4.5 ,选摘要生涯的脉冲瞬态荧光动力学数据 ,点击右侧的【另存为】 ,可将表格中的数据以.csv名堂生涯到PC端 ,后续用Excel即可审查或编辑 ,选择存储方法如图4.6 。



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4.5 表格模式另存为
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4.6 选择贮存方法


找到生涯的名堂为.csv的文件 ,如图4.7 。

第一行划分为文件名 ,日期、时间、丈量项(slowkin)及设定的参数SL=8000 ,n=6 ,AL=400 。

第二行是数字 ,每个数字代表一个给光阶段 ,如1代表饱和脉冲 ,2代表光化光 ,3代表再次饱和脉冲,4代表再次光化光阶段 。

第三行划分给出该阶段所用光照的强度 。OJIP(8000/1s)代表饱和脉冲的强度和时间 ,PulseMeas(AL400:30s)代表光化光的强度和时间 。

第四行time代表时间 ,D1和D2代表实测的数据 。



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4.7  excel翻开csv名堂的脉冲瞬态荧光动力学原始数据文件


绘制脉冲瞬态荧光动力学曲线(荧光值随时间转变的曲线)时 ,表格中的数据凭证每个阶段成一列给出 。如第一个饱和脉冲为如图4.7第1和2列 ,第一个光化光数据为第3-5列 ,以此类推 。建议选择饱和脉冲中的最大荧光值即Fm(Fm’)和光化光的所有值 ,凭证时间先后排序为一列作图即可 。

以六次饱和脉冲光为例 ,建议制作脉冲瞬态荧光动力学曲线x轴时间选取数据共157个 ,选取0.5 s、1-30s、30.5s、31-60s、60.5s、61-90s、90.5s、91-120s、120.5s、121-150s、150.5s ,选择好后排为一列作图 。

详细时间划分为500ms、1s、2 s、3 s、4 s、5 s、6 s、7 s、8 s、9 s、10 s、11 s、12 s、13 s、14 s、15 s、16 s、17 s、18 s、19 s、20 s、21 s、22 s、23 s、24 s、25 s、26 s、27 s、28 s、29 s、30 s、30.5 s、31 s、32 s、33 s、34s、35s、36 s、37 s、38 s、39 s、40 s、41 s、42 s、43 s、44 s、45 s、46 s、47 s、48 s、49 s、50 s、51 s、52 s、53 s、54 s、55 s、56 s、57 s、58 s、59 s、60 s、60.5 s、61 s、62 s、63 s、64 s、65 s、66 s、67 s、68 s、69 s、70 s、71 s、72 s、73 s、74 s、75 s、76 s、77 s、78 s、79 s、80 s、81 s、82 s、83 s、84 s、85 s、86 s、87 s、88 s、89 s、90 s、90.5 s、91 s、92 s、93 s、94 s 、95 s 、96 s 、97 s 、98 s 、99 s 、100 s、101 s 、102 s 、103 s 、104 s 、105 s、106 s、107 s、108 s、109 s、110 s、111 s、112 s、113 s、114 s、115 s、116 s、117 s、118 s、119 s、120 s、120.5 s、121 s、122 s、123 s、124 s、125 s、126 s、127 s、128 s、129 s、130 s、131 s、132 s、133 s、134 s、135 s、136 s、137 s、138 s、139 s、140 s、141 s、142 s、143 s、144 s、145 s、146 s、147 s、148 s、149 s、150 s、150.5 s 。

将所选取的时间点作为x轴坐标数据 ,在导出表格中其所对应的D1数据为y轴数据 ,新建excel表格粘贴两组数据 ,框选两组数据 ,点击工具栏中的插入界面 ,进入图标栏 ,插入带平滑线的散点图 。


Yaxin-1165/1168荧光动力学丈量系统数据导出与整理的要领

4.8  excel完成的脉冲瞬态荧光动力学曲线图


以上内容为Yaxin-1165植物荧光动力学丈量系统与Yaxin-1168藻类荧光动力学丈量系统的数据整理功效 。尤其重点先容了数据导出后怎样在EXCEL中凭证数据绘制图形等历程 。其他部分可以详见产品使用指南 。


Yaxin-1165/1168荧光动力学丈量系统数据导出与整理的要领


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